Análisis de coevolución en alineamientos múltiples de secuencias de proteínas evolucionados artificialmente

Abstract

El objetivo general de este trabajo es estudiar y analizar la relación entre coevolución y conservación derivados de MSAs en cuanto a su capacidad para predecir contactos en estructuras terciarias de proteínas. En este estudio proponemos dicho análisis en MSAs naturales y derivados de simulaciones computacionales utilizando el software SCPE. Nuestra principal hipótesis es que el SCPE provee una adecuada simulación del proceso evolutivo bajo la conservación de una estructura con la cual contrastar el proceso coevolutivo en los alineamientos naturales, mucho más complejos y diversos.